Valaiden alkuperä ja kehitys on ollut kuuma ja kiivas tieteenala viimeisten vuosien ajan, sen jälkeen kun tuli tietoisuuteen, että valaat ovat kehittyneet sorkkaeläimien lahkosta (Artiodactyla) molekyylidataan perustuen ja takajaloista löytyneen yksilöllisen luun (astragulus) perusteella. Kyseisen luun jakavat alkukantaisimmat valaat ja kaikki elävät ja sukupuuttoon kuolleet sorkkaeläimet. Valaiden lähimmäksi sukulaisiksi on arvuuteltu virtahepoja sekä monia muita nisäkkäitä.

Nature lehden joulukuun numerossa J. G. M. Thewissen and hänen kolleegansa yhdistävät valaiden lähimmäksi sukulaiseksi pienen peuran kaltaisen nisäkkään Indohyuksen. Valaita ja tätä nisäkästä yhdistää kallon muodot (thickened medial lip of the auditory bulla) ja samankaltaiset etuhampaat (incisors).

Kiinnostava seurata löytyykö jostain puuttuva linkki alkukantaisten valaiden ja maanisäkkäiden välille.

Thewissen et al. (2007). Whales originated from aquatic artiodactyls in the Eocene epoch of India. Nature v. 450:7173.